A Afipea é a única entidade representante dos servidores do Ipea. A organização engloba todos os servidores de carreira do órgão, tanto das atividades de pesquisa quanto de apoio, envolvendo aqueles de nível superior e médio. Todos são profissionais reconhecidos pelo alto nível das atividades desempenhadas. A Afipea é vinculada ao Ciclo de Gestão, a união de quatro entidades AACE, ANESP, ASSSECOR e Afipea. O Ciclo de Gestão representa carreiras públicas responsáveis por atividades necessárias à gestão e avaliação de políticas públicas direcionadas à promoção do desenvolvimento nacional e à melhoria do acesso a serviços públicos. A Afipea também faz parte do Fórum Nacional Permanente de Carreiras Típicas de Estado (FONACATE), uma associação civil, integrada exclusivamente por entidades nacionais associativas e sindicais, representativas das carreiras que desenvolvem atividades essenciais e exclusivas do Estado, em todos os Poderes, no âmbito federal, estadual, distrital e municipal.